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Le cancer du poumon est un problème majeur de santé publique en raison de son pronostic et de sa grande fréquence. Environ 30 000 nouveaux cas sont diagnostiqués chaque année pour la seule France. La difficulté dans l'évolution des connaissances vient souvent d'une progression en continuum, dont les éléments constitutifs n'ont pas de limites nettes. En apparence rien ne se fait et pourtant tout évolue. La nature même du cancer du poumon se transforme avec l'augmentation inquiétante des cancers chez les sujets non-fumeurs, en particulier chez la femme, l'augmentation des adénocarcinomes, la prévalence de plus en plus élevée des cancers chez les sujets âgés, etc. Les travaux scientifiques consacrés chaque année à cette tumeur sont pléthoriques, et dans tous les domaines : épidémiologie, prévention, dépistage, diagnostic, classification, pronostic, biologie et thérapeutique. Cette abondance de travaux rend difficile le maintien à jour des connaissances personnelles du médecin et légitime la publication de cet ouvrage. Les spécialistes reconnus de différentes disciplines, fédérés autour du Professeur Alain Depierre, donnent des repères simples sur cette thématique en constante évolution, notamment thérapeutique, et fournissent au praticien une mise au point synthétique.

L'homme, selon la modernité occidentale, prend conscience de lui-même dans sa finitude. Il sait que vivre c'est agir, que vivre c'est désirer, que vivre c'est avoir souci de soi et des autres, mais que la mort, certaine, sera la fin du désir, la fin de l'agir, la fin de l'amour. Il sent que leur transmutation dans un salut céleste est plus qu'incertaine, que son annonce est devenue inaudible. Aussi écoute-t-il la voix venue de l'Orient : et si vivre c'était non-agir ? Si la vitalité c'était de ne plus éprouver le manque, mais de se nicher dans une totalité perdue et d'y retrouver une plénitude oubliée ? Extrait vidéo : Wuwei, a philosopy of non acting, Roland DEPIERRE What if living was non acting? Is this notion, which contemporary thought interprets as refusing immoderate activism in world apprehension, really faithful to Chinese thought of Taoist inspiration? Could it introduce a relation to the perfect fullness of the world which might be instructive for us?

Chromatin is the template of transcriptional programs and gene expression regulations. Chromatin based regulations involve crosstalks between transcriptional activity with histone modifiers or modifications, binding of transcription factors to enhancers and promoters, or of architectural proteins to insulators, and chromatin topology. Genome is subdivided in euchromatin and heterochromatin domains. Euchromatin is mostly associated with active genes and enriched in H3K36 and H3K4 methylations while heterochromatin, contributing to genes silencing, is enriched in H3K27me3 when facultative heterochromatin or H3K9me3 when pericentromeric or telomeric heterochromatin. On top of this linear organisation, chromatin is further folded in topologically associated domains (TADs) and compartments that cluster spatially, which lead to the clustering of chromatin domains that share similar functions. Insulators are anchors that regulate chromatin topology by creating or stabilizing loops isolating TADs from each other. Evidences demonstrate that both chromatin state and topological structures can influence or dictate gene expression, and conversely, chromatin is modified by transcription-coupled processes and transcription factories may participate to the formation of compartments. Whether global rules govern such crosstalks at the genome-wide levels, remain unclear. Moreover, whether some kind of hierarchy exists among such influences of chromatin related processes remains poorly understood. During my thesis, I have analysed the respective influence of both H3K36 di-methylation and tri-methylation in maintaining euchromatin domains. I have further contributed to the development of a computational method aiming to understand the role of insulators. H3K36me2 and me3 are both enriched in euchromatin domains and are reported to globally counteract repressive H3K27me3 deposition; however, it is unclear whether di-methylation is sufficient for this blocking or is just an intermediary stage for tri-methylation. Those modifications are ensured by unique or multiple histone methyltransferases (HMTs), depending on species, which can hinder the characterisation of their respective roles. In Drosophila, H3K36me2 is specifically done by Mes-4/dNSD1 that is thought to be recruited at domain borders via insulators. In contrast, HypB/SETD2 may decorate genes with H3K36me3 co-transcriptionnally. Depletions of either Mes-4/dNSD1 or HypB/SETD2 lead to specific increases of H3K27me3, causing genes repression. These results indicate that both Mes 4/dNSD1 and HypB/SETD2 are able to protect genes from H3K27me3 spreading independently of each other. Of interest, our results highlight that a specific role of each of these HMTs depends on chromatin topological contexts. Mes-4/dNSD1 protects euchromatin genes at insulator-associated TAD borders while HypB/SETD2 repels H3K27me3 on active genes located on fuzzy hetero-euchromatin borders lacking insulator anchoring. In a second manuscript, we have developed tools to visualize long-range interactions (LRIs) detected in Hi-C contact maps to improve the detection of LRIs through quantilization of contact frequencies. We further developed Hi-C aggregation plots to enable the analysis of asymmetric LRIs such as enhancer-promoter or insulator-promoter contacts, by orientating the sub-matrices before aggregation. Our method allows to accurately distinguish insulators from enhancers depending on surrounding Hi-C contacts with potential "leaks" when LRIs are not block by an insulator. Depletion of CTCF confirms the existence of such leaks. Quantification of the Hi-C signal at single-locus levels allows LRIs detection, confirming that leaks occurring upon CTCF depletion are specific to CTCF binding sites. Thus, our method provides a comprehensive detection of differential LRIs surrounding insulators, rendering possible discoveries regarding insulators, mechanisms and associated factors.

Rationnel : l'hypothyroïdie congénitale est une maladie chronique rare qui est caractérisée par un dysfonctionnement de la glande thyroïdienne des nouveaux - nés. L'apparition du dépistage néonatal systématique en France géré par l'AFDPHE a permis une prise en charge thérapeutique précoce de la maladie afin d'éviter les complications ultérieures. Le CHU de Besançon est le centre de dépistage de l'HC en Franche - Comté. Objectif : une étude rétrospective sur dix ans, a été réalisée au sein du CHU de Besançon afin d'établir une cartographie du dépistage et de la prise en charge de l'HC en Franche -Comté. Matériels et méthodes : une étude rétrospective de 2006 à 2015 a été réalisée au sein du CHU de Besançon sur l'ensemble des enfants nés en Franche - Comté. Cette étude s'est focalisée sur le dépistage néonatal de l'HC. La consultation des dossiers des enfants dans les services de l'ARDEMME (Association Régionale pour le Dépistage et l'Etude des Maladies Métaboliques de l'Enfant) et de Médecine Nucléaire a permis de compléter une grille de recueil pré établie (date de naissance, poids, diagnostic, traitement, suivi). Résultats : Depuis 2006, en Franche - Comté, on a répertorié un total de 588 enfants dépistés par le programme de dépistage néonatal, 55 enfants diagnostiqués d'HC, avec un sexe ratio de 0,8 et une incidence de 0,04%. Chaque année, il y a en moyenne 59 enfants dont le test de Guthrie est positif parmi lesquels : 11 enfants sont diagnostiqués d'HC, 8 ont bénéficiés d'une scintigraphie thyroïdienne à l'iodure de sodium 123, et 8 sont traités par L -thyroxine. Parmi ces 11 HC, 2 sont des HC de type ectopie, 1 est une HC avec athyréose, 3 sont des HC avec un trouble de l'hormonogenèse, 3 des HC transitoires avec glande en place, 2 sont des HC persistantes avec glande en place et l'arrêt de l'hormonothérapie (en moyenne un enfant par an) pour les HC transitoires et persistantes se fait entre un et trois ans de vie. Le nombre de faux négatifs en 10 ans est seulement de deux. Discussion et perspectives : l'étude nous montre qu'il existe des différences entre la pratique et les données nationales ; notamment sur le sexe ratio qui est en faveur des garçons, le traitement de l'athyréose avec des posologies plus faibles. On remarque que le nombre d'enfant dépisté est stable au cours des années, il n'y a donc pas d'évolution. On remarque que le nombre d'enfant dépisté est stable au cours des années, il n'y a donc pas d'évolution. L'arrêt du traitement autour des trois ans est conditionné par la maturation de la glande thyroïde. En Franche - Comté, 9,4% des enfants dépistés sont véritablement atteints d'HC sur les dix dernières années. Ce dépistage permet de tester un maximum de nouveaux nés dans le but de ne manquer aucun diagnostic d'HC. Ce dépistage est une sécurité pour tous les nouveaux nés et un outil indispensable en santé publique. Une enquête sur la qualité de vie de ces jeunes patients atteints d'HC suivant un traitement à vie serait intéressant à explorer ainsi qu'une enquête sur la compliance au traitement auprès des parents.

La collection présente des artistes chinois contemporains qui, tous, utilisent les Cinq objets précieux du lettré, ceux qui firent la spécificité de la peinture chinoise classique pendant deux millénaires. À la différence de l’autre grand courant des plasticiens contemporains qui, comme Ai Weiwei ou Yue Minjun emploient les moyens et les supports de leurs confrères occidentaux (acrylique, sculpture, vidéo, photographie, collage, performance, body et land-art), ceux-ci cultivent le plaisir de jouer du pinceau sur le fragile papier de riz, de frotter le bâton d’encre dans le creux mouillé d’une pierre sculptée, de graver un colophon avec un sceau enduit de son vermillon, d’encoller l’oeuvre séchée sur un support avec un encadrement de soie grège, comme sur un rouleau.