Chapitre 2 - Évolution des archées et de leur taxonomie

La taxonomie des Archées a évolué en fonction des méthodes utilisées pour déterminer leurs relations évolutives et de nos connaissances sur leur diversité. Pendant longtemps, le nombre de phylums d’archée est resté limité à trois ou quatre. Avec l’essor de la génomique et de la métagénomique ce nombre a explosé et le concept de superphylum est apparu. Tous les phylums et superphylums d’Archée connus à ce jour sont décrit dans ce chapitre. Récemment, la taxonomie des Archées a été entièrement refondue sur la base d’une phylogénie protéiques. Toutefois, l’enracinement de cette phylogénie est controversé et la nomenclature proposée peut prêter à confusion. La nature du dernier ancêtre commun des Archées, hyperthermophile et/ou méthanogène, est toujours en débat. Mots-clés : euryarchaea, crénarchées, TACK superphylum, DPANN superphylum, asgard superphylum, LACA, origine de la méthanogénèse. DOI : 10.51926/ISTE.9168.ch2 Chapitre de l'ouvrage : Les archées, micro-organismes du troisième domaine du vivant 1 / DOI : 10.51926/ISTE.481686 / ISBN : 9781789481686